RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 NUP58Q9BVL2 599 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.98■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 C9IYK1 514 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 NFICP08651 508 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PON1P27169 355 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM14Q14142 442 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 EPC2Q52LR7 807 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 XKR4Q5GH76 650 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 KIF12Q96FN5 646 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.97■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC9A1P19634 815 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 MFSD5Q6N075 450 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM199Q8N511 208 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 NEK11Q8NG66 645 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 IQCDQ96DY2 449 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 KLK14Q9P0G3 267 aa25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PHACTR2O75167 634 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 EOMESO95936 686 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ITGB8P26012 769 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM189BP81408 668 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM84AQ96KN4 292 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CCDC71L-201ENST00000315965 ENPP3O14638 875 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TPM1P09493 284 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 KCNE1P15382 129 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 FIGNQ5HY92 759 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIM65Q6PJ69 517 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF169Q8NCN4 708 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 LPPQ93052 612 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB20Q9NX57 234 aa25.95■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 PIK3CAP42336 1068 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 LMO3Q8TAP4 145 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RSAD1Q9HA92 442 aa25.94■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 MLH1P40692 756 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TCTN1Q2MV58 587 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 CXCL16Q9H2A7 254 aa25.93■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 VNN1O95497 513 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 HLA-DRAP01903 254 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 GYPCP04921 128 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 PFKMP08237 780 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ACTN1P12814 892 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 CSF2RAP15509 400 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 NCOA4Q13772 614 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 IKBKEQ14164 716 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBTB6Q15916 424 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 BEST2Q8NFU1 509 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 SEMA4DQ92854 862 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 GAD1Q99259 594 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 MICAL3Q7RTP6 2002 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 GSDMDP57764 484 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TRPC3Q13507 836 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 C1orf127Q8N9H9 656 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ZFP42Q96MM3 310 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 SIX2Q9NPC8 291 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 DPP3Q9NY33 737 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.91■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ARL5CA6NH57 179 aa25.9■■□□□ 1.74
CCDC71L-201ENST00000315965 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms