RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.76□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.76□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 IVDP26440 423 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CHKAP35790 457 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CETN2P41208 172 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 34.6
MKS1-201ENST00000313863 SNX1Q13596 522 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SETDB1Q15047 1291 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 KYNUQ16719 465 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 AOC3Q16853 763 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CCDC174Q6PII3 467 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TP73O15350 636 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 RARRES1P49788 294 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 NCKAP1LP55160 1127 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 BPIFB4P59827 614 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 UBXN2AP68543 259 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ACCSLQ4AC99 568 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CHADLQ6NUI6 762 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 NSMFQ6X4W1 530 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 GDAP1Q8TB36 358 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 HELQQ8TDG4 1101 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TMX2Q9Y320 296 aa14.75□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 A0A1W2PRG0 241 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PSTPIP1O43586 416 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CCNG2Q16589 344 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TTC25Q96NG3 672 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PPCSQ9HAB8 311 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CHST7Q9NS84 486 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SENP1Q9P0U3 644 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.74□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 KRT16P08779 473 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SCP2P22307 547 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ALDH3A1P30838 453 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SLC18A1P54219 525 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 GCNT1Q02742 428 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PARP6Q2NL67 630 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 LIN9Q5TKA1 542 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 FITM2Q8N6M3 262 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 RAB20Q9NX57 234 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CCDC189A1A4V9 331 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TISP43B9A030 160 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 UNC5CO95185 931 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ADRB2P07550 413 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CCNG1P51959 295 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DACT2Q5SW24 774 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 FAM182BQ5T319 152 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 SEMA4DQ92854 862 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CSRNP1Q96S65 589 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 USP21Q9UK80 565 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 BCS1LQ9Y276 419 aa14.73□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 MAGEB2O15479 319 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DCTN3O75935 186 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 KRT5P13647 590 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CNKSR1Q969H4 720 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 FAM212AQ96EL1 285 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.72□□□□□ -0.05
MKS1-201ENST00000313863 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms