RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 MS4A14Q96JA4 679 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FAM53CQ9NYF3 392 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ASAP2O43150 1006 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 USP8P40818 1118 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TMEM62Q0P6H9 643 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 LRRC57Q8N9N7 239 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FAM212AQ96EL1 285 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PTPRHQ9HD43 1115 aa23■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 AGPAT1Q99943 283 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ATP8B3O60423 1300 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ANK1P16157 1881 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SASH3O75995 380 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SGPL1O95470 568 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 VNN1O95497 513 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 F2P00734 622 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PROZP22891 400 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 MCL1Q07820 350 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ZACNQ401N2 412 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TMEM192Q8IY95 271 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CPB2Q96IY4 423 aa22.99■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CCDC151A5D8V7 595 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TNFAIP3P21580 790 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TMOD1P28289 359 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PHKA2P46019 1235 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TUBB4BP68371 445 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 BIRC3Q13489 604 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 AMHR2Q16671 573 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NLRP7Q8WX94 980 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NT5C1BQ96P26 610 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 OGTO15294 1046 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 HLA-DRAP01903 254 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 MYL3P08590 195 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CCDC172P0C7W6 258 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FGFR4P22455 802 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 BRD3Q15059 726 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TRIB2Q92519 343 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 INTUQ9ULD6 942 aa22.98■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 MYADML2A6NDP7 307 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CYP26A1O43174 497 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ABCB4P21439 1286 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TRIM32Q13049 653 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SHC3Q92529 594 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CGRRF1Q99675 332 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 GINS2Q9Y248 185 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FLT3LGP49771 235 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ENPEPQ07075 957 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 KIZQ2M2Z5 673 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SCLT1Q96NL6 688 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CDT1Q9H211 546 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TSKSQ9UJT2 592 aa22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 GPR25O00155 361 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CALCAP01258 141 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 CHRNB2P17787 502 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 PIK3CAP42336 1068 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FCGRTP55899 365 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 MFSD10Q14728 455 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TAF3Q5VWG9 929 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 IRF5Q13568 498 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.96■■□□□ 1.27
SOX17-201ENST00000297316 THAP2Q9H0W7 228 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms