RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL16-201ENST00000293778 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL16-201ENST00000293778 C18orf8Q96DM3 657 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL16-201ENST00000293778 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL16-201ENST00000293778 NFS1Q9Y697 457 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL16-201ENST00000293778 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PPFIA4O75335 1185 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 EDN1P05305 212 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 RWDD2BP57060 319 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CAPSQ13938 189 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 FMO2Q99518 471 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CGRRF1Q99675 332 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ADM5C9JUS6 153 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PTGIRP43119 386 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 A6NNZ2 444 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ADCY3O60266 1144 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MYZAPP0CAP1 466 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TGFB3P10600 412 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CUL2Q13617 745 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 SULF1Q8IWU6 871 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM11Q96F44 468 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 IRF6O14896 467 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ERLIN2O94905 339 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MYBL1P10243 752 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MAPK4P31152 587 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ATP1A2P50993 1020 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF844Q08AG5 666 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 METTL7BQ6UX53 244 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ELP3Q9H9T3 547 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 GRIN2DO15399 1336 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 OTOFQ9HC10 1997 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 NR1D1P20393 614 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 EMC10Q5UCC4 262 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TTC27Q6P3X3 843 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 OTUD5Q96G74 571 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 SNX24Q9Y343 169 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.37■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PPFIA2O75334 1257 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 NSFP46459 744 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 DRP2Q13474 957 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CYP1B1Q16678 543 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 LY6KQ17RY6 165 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 FAM167AQ96KS9 214 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CENPHQ9H3R5 247 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 AZI2Q9H6S1 392 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PODXLO00592 558 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 RRM1P23921 792 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CENPCQ03188 943 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 SEZ6Q53EL9 994 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 OR5B17Q8NGF7 314 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.36■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CLDN3O15551 220 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 CLTAP09496 248 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 PDCLQ13371 301 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM270Q6UE05 265 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 ZPBP2Q6X784 338 aa21.35■■□□□ 1.01
CXCL16-201ENST00000293778 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms