RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 CPXCR1Q8N123 301 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 KIF9Q9HAQ2 790 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ANAPC7Q9UJX3 599 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 UBE4BO95155 1302 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CNTNAP1P78357 1384 aa10.61□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CFAP73A6NFT4 308 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 NFIBO00712 420 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GGPS1O95749 300 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TTC4O95801 387 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RRM1P23921 792 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CAPN12Q6ZSI9 719 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC9A9Q8IVB4 645 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 OGFOD1Q8N543 542 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TAS1R2Q8TE23 839 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TMEM237Q96Q45 408 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 LRRC19Q9H756 370 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 COL4A5P29400 1685 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 NEBLO76041 1014 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MTA2O94776 668 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GJB6O95452 261 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ALADP13716 330 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ITGB5P18084 799 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 STX2P32856 288 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SOX10P56693 466 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RIPK1Q13546 671 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TMED2Q15363 201 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM151AQ8WW52 585 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CPA5Q8WXQ8 436 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SHC3Q92529 594 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SNF8Q96H20 258 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SERPINB12Q96P63 405 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TEKT3Q9BXF9 490 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 COL20A1Q9P218 1284 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 STK24Q9Y6E0 443 aa10.6□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 FSCN2O14926 492 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GRIN3BO60391 1043 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CFHP08603 1231 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 KRT5P13647 590 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ADSSP30520 456 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GBP1P32455 592 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ADCY8P40145 1251 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MSH2P43246 934 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 PEX3P56589 373 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TCEAL1Q15170 157 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CLUL1Q15846 466 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 UGCGQ16739 394 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 HELQQ8TDG4 1101 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 WHRNQ9P202 907 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 PIAS1O75925 651 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ATF2P15336 505 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 TAC1P20366 129 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RFX1P22670 979 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 MAPK4P31152 587 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 PLA2G4FQ68DD2 849 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ASRGL1Q7L266 308 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF341Q9BYN7 854 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 DCLK3Q9C098 648 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.59□□□□□ -0.71
CHRNA6-201ENST00000276410 ANAPC5Q9UJX4 755 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.4 ms