RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273347.9

NXPE3-201, Transcript of neurexophilin and PC-esterase domain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXPE3, Length 3,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3-201ENST00000273347 MTFR1LQ9H019 292 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NLRP14Q86W24 1093 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PORCNQ9H237 461 aa14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 EXTL3O43909 919 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 FAM107AO95990 144 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 DRP2Q13474 957 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RAB17Q9H0T7 212 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MYZAPP0CAP1 466 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MMP13P45452 471 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MTMR3Q13615 1198 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF653Q96CK0 615 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PGM2Q96G03 612 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CHST7Q9NS84 486 aa14.49□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SOCS7O14512 581 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RRM1P23921 792 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 KCNJ1P48048 391 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PMS2P54278 862 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 EMC2Q15006 297 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 C2CD6Q53TS8 623 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NT5C1BQ96P26 610 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RUFY1Q96T51 708 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 GGA2Q9UJY4 613 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 A0A0B4J269 797 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 A6NNZ2 444 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PPP2R2AP63151 447 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PPP2R5EQ16537 467 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RAPGEF5Q92565 580 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 WRNIP1Q96S55 665 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MAF1Q9H063 256 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RIPK2O43353 540 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PSAPP07602 524 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 HSPA6P17066 643 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NOMO3P69849 1222 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CNTN2Q02246 1040 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NLRX1Q86UT6 975 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 EURLQ9NYK6 297 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PNMA2Q9UL42 364 aa14.48□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CLDN3O15551 220 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SORBS3O60504 671 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PDE6CP51160 858 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ADCY2Q08462 1091 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 DLK2Q6UY11 383 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 STAM2O75886 525 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TCF4P15884 667 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CHKAP35790 457 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SMTNP53814 917 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TAS2R40P59535 323 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CETN1Q12798 172 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SLC29A2Q14542 456 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 TREML2Q5T2D2 321 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 BTBD7Q9P203 1132 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 HLA-DRAP01903 254 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 PLTPP55058 493 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.47□□□□□ -0.09
NXPE3-201ENST00000273347 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms