RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 EFCAB8A8MWE9 144 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 HAS3O00219 553 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ZEB2O60315 1214 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 TADA3O75528 432 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 H2AFZP0C0S5 128 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MCF2P10911 925 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 TNNI1P19237 187 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2B6P20813 491 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CPT1AP50416 773 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 FCGRTP55899 365 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 IGBP1P78318 339 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 NKX3-2P78367 333 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 AMHR2Q16671 573 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGAP44Q17R89 818 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR44Q5JSH3 913 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 H2AFVQ71UI9 128 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 KAT2BQ92831 832 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 FAXDC2Q96IV6 333 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 ARID2Q68CP9 1835 aa10.28□□□□□ -0.76
APOBEC1-201ENST00000229304 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 B4GALT4O60513 344 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 KPNA6O60684 536 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRN2O75325 713 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 IL18RAPO95256 599 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-DRAP01903 254 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2C19P33261 490 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 APLP1P51693 650 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 WNT7BP56706 349 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 NOGQ13253 232 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TCEAL1Q15170 157 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CCL14Q16627 93 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 MNS1Q8NEH6 495 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD7Q92527 254 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 AGPAT1Q99943 283 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TCHPQ9BT92 498 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CARD6Q9BX69 1037 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CDT1Q9H211 546 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TFR2Q9UP52 801 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 AKT3Q9Y243 479 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXNB2O15031 1838 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WZ62 844 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 MOCS3O95396 460 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 VNN1O95497 513 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 GJB1P08034 283 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CLTAP09496 248 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 IQCF3P0C7M6 154 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM253P0C7T8 217 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 GZMAP12544 262 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 AKR1A1P14550 325 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFAIP3P21580 790 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 CTGFP29279 349 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 HOXC8P31273 242 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 PIK3CAP42336 1068 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 BPIFB4P59827 614 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM17P78536 824 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 NFRKBQ6P4R8 1299 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF677Q86XU0 584 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 KAT5Q92993 513 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC1-201ENST00000229304 ZIC5Q96T25 663 aa10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms