RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 CASP8Q14790 479 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 RFFLQ8WZ73 363 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 COG5Q9UP83 839 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 H3BRB1 525 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ACKR2O00590 384 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 VTNP04004 478 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 MCL1Q07820 350 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC181Q5TID7 509 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.02■□□□□ 0.8
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD62A6NC57 917 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PPFIA4O75335 1185 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MMP3P08254 477 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PROZP22891 400 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 WDR44Q5JSH3 913 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 DAAM2Q86T65 1068 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 A0A087WZ62 844 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 OGTO15294 1046 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CLSTN1O94985 981 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 KIF4AO95239 1232 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PDE6CP51160 858 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 RPS6KA1Q15418 735 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 HINFPQ9BQA5 517 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ISCUQ9H1K1 167 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 AKT3Q9Y243 479 aa20.01■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MGAMO43451 1857 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 KCNK3O14649 394 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MORN1Q5T089 497 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CHADLQ6NUI6 762 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM192Q8IY95 271 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 NUB1Q9Y5A7 615 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZMYND10O75800 440 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CDR2Q01850 454 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PEX26Q7Z412 305 aa20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF236Q9UL36 1845 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PHACTR2O75167 634 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CST3P01034 146 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 NCOA4Q13772 614 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CCL14Q16627 93 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MAP9Q49MG5 647 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa19.99■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 ASAP2O43150 1006 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 RTN2O75298 545 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PAFAH1B1P43034 410 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 GYS2P54840 703 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TNFAIP2Q03169 654 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 PPFIA1Q13136 1202 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CUL2Q13617 745 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 GRIK4Q16099 956 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CFAP221Q4G0U5 840 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 HDAC7Q8WUI4 952 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 CDT1Q9H211 546 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 VIPAS39Q9H9C1 493 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 MAGEB2O15479 319 aa19.98■□□□□ 0.79
SIKE1-201ENST00000060969 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms