RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.73■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 AMFRQ9UKV5 643 aa25.73■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.73■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.73■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 PBKQ96KB5 322 aa25.73■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 SELENOOQ9BVL4 669 aa25.73■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.73■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 BPIFB4P59827 614 aa25.72■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 KAT6AQ92794 2004 aa25.7■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.7■■□□□ 1.71
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.7■■□□□ 1.71
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RPUSD1-201ENST00000007264 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.7■■□□□ 1.7
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RPUSD1-201ENST00000007264 C8orf74Q6P047 294 aa25.67■■□□□ 1.7
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RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC1Q9BTT6 524 aa25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 CDT1Q9H211 546 aa25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.67■■□□□ 1.7
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM270Q6UE05 265 aa25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 USP38Q8NB14 1042 aa25.67■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 TNNC2P02585 160 aa25.66■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.66■■□□□ 1.7
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.66■■□□□ 1.7
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