RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mmp2	P33434	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Inmt	P40936	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ppp2cb	P62715	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ppp2ca	P63330	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tek	Q02858	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sox10	Q04888	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ect2	Q07139	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4930438A08Rik	Q5SPH3	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcbp2	Q61990	362 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rbm38	Q62176	237 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Xpa	Q64267	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Astl	Q6HA09	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Podnl1	Q6P3Y9	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bank1	Q80VH0	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccdc187	Q8C5V8	958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4930572O03Rik	Q8C5Y0	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gspt1	Q8R050	636 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dcaf11	Q91VU6	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ncoa5	Q91W39	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ndufs2	Q91WD5	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcdhga4	Q91XY4	930 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ucn3	Q924A4	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atg3	Q9CPX6	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Speer4f1	Q9D5Q6	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Vmn1r41	Q9EQ44	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bves	Q9ES83	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ldb3	Q9JKS4	723 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hip1r	Q9JKY5	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mx2	Q9WVP9	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ecm29	Q6PDI5	1840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Syngap1	F6SEU4	1340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ddx60	E9PZQ1	1711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcna-ps2	A0A140T8V5	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm2237	E9Q501	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp277	E9Q6D6	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kifc3	O35231	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rac3	P60764	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pla2g5	P97391	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q32P12	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gcnt7	Q3V3K7	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sfmbt2	Q5DTW2	938 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Foxn1	Q61575	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sez6l	Q6P1D5	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pdzph1	Q8BGR1	1238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pnpla2	Q8BJ56	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Srp68	Q8BMA6	625 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bora	Q8BS90	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rapgef5	Q8C0Q9	814 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	P3h2	Q8CG71	703 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mtfr2	Q8VED8	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hnrnpu	Q8VEK3	800 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Frs3	Q91WJ0	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zbtb3	Q91X45	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fibin	Q9CQS3	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam111a	Q9D2L9	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tktl2	Q9D4D4	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lce1d	Q9D731	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfpl1	Q9DB43	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sec61a2	Q9JLR1	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Heph	Q9Z0Z4	1157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pcdh15	Q99PJ1	1943 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ace	P09470	1312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Xkr6	E9Q6C8	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Erbb2	P70424	1256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cct2	P80314	535 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cyp2e1	Q05421	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048		Q3UJP5	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tmem253	Q3UNB8	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mansc4	Q3UU94	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zc3h12a	Q5D1E7	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc5a6	Q5U4D8	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ceacam10	Q61400	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ltv1	Q6NSQ7	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rasa4	Q6PFQ7	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pum2	Q80U58	1066 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Serpinb9f	Q80UK5	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam160b2	Q80YR2	744 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp418	Q8BFS8	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm5591	Q8CDK1	855 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Acpp	Q8CE08	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Parp10	Q8CIE4	960 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hmces	Q8R1M0	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ushbp1	Q8R370	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc22a19	Q8VCA0	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Olfr24	Q8VFM9	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pde6c	Q91ZQ1	861 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ino80b	Q99PT3	375 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lman1	Q9D0F3	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam187a	Q9D3R5	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aven	Q9D9K3	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Oxct2a	Q9JJN4	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kmt2e	Q3UG20	1868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Uhrf1bp1	B2KF50	1429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prr14l	E9Q7C4	1971 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mroh4	G3X8W1	983 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ncf2	O70145	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ctsa	P16675	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Folr1	P35846	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lrch1	P62046	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Atp1b3	P97370	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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