RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047830.7

Hoxd3-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rnf25Q9QZR0 456 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Hao1Q9WU19 370 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Plxnb2B2RXS4 1842 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tlk2O55047 718 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PdgfraP26618 1089 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mark3Q03141 753 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Slc24a2Q14BI1 711 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Styk1Q6J9G1 429 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Adat2Q6P6J0 191 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Spata24Q6P926 205 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cpa1Q7TPZ8 419 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Azin2Q8BVM4 459 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Sh3rf3Q8C120 878 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 AslQ91YI0 464 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rex1bdQ9CYZ6 169 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Trmt10bQ9D075 318 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Lman1Q9D0F3 517 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gbp2Q9Z0E6 589 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Myh11O08638 1972 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ifnb1P01575 182 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cd68P31996 326 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Nell2Q61220 819 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Pla2g4cQ64GA5 597 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 NostrinQ6WKZ7 506 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fam185aQ7TPD2 378 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tmc4Q7TQ65 694 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tmem117Q8BH18 514 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Proser2Q8C5R2 471 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Dcaf8Q8N7N5 591 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Lpgat1Q91YX5 370 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cpne8Q9DC53 577 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Anxa9Q9JHQ0 345 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm9268E9Q0M3 861 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Usp17ldG5E8G2 545 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Usp17lcG5E8I7 545 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Vmn2r62K7N712 859 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 OatP29758 439 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 YdjcQ14BV6 310 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Dzip1lQ499E4 774 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gm14685Q52KH6 695 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Chsy1Q6ZQ11 800 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Raver2Q7TPD6 673 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Dupd1Q8BK84 215 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ago4Q8CJF8 861 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 IdeQ9JHR7 1019 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 IqccA2ADZ8 418 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cdh16O88338 830 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Odr4Q4PJX1 447 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 GnasQ6R0H7 1133 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Setd3Q91WC0 594 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rin1Q921Q7 763 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 CaluO35887 315 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Crnkl1P63154 690 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fam193bQ3U2K0 892 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 PapolaQ61183 739 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Impg2Q80XH2 1243 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 CnstQ8CBC4 711 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Caskin2Q8VHK1 1201 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Nmrk1Q91W63 195 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Med15Q924H2 789 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Toe1Q9D2E2 511 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tmed2Q9R0Q3 201 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ttc6G3UYY4 1857 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Rrm1P07742 792 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Cdk16Q04735 496 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 BC048507Q80ZS7 89 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kctd6Q8BNL5 237 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 CenpuQ8C4M7 410 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Fbxo43Q8CDI2 640 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Kat5Q8CHK4 513 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Slc25a38Q91XD8 326 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Krt90E9Q1Z0 538 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Tekt5G5E8A8 557 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Mgat1P27808 447 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gtf2bP62915 316 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 KizQ3UXL4 695 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 RilpQ5ND29 369 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Gas7Q60780 421 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Lamc2Q61092 1191 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Atp4aQ64436 1033 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd3-201ENSMUST00000047830 Erich5Q8K0S2 362 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms