RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adcy8P97490 1249 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcf12Q61286 706 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adat2Q6P6J0 191 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zswim5Q80TC6 1188 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scrn2Q8VCA8 425 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankef1Q9D2J7 775 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab11fip1Q9D620 645 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc182Q9D9C6 152 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pds5aQ6A026 1332 aa23.52■■□□□ 1.36
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnfrsf18O35714 228 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ptprn2P80560 1001 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taok1Q5F2E8 1001 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spdye4aQ5IBH6 268 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Klra7Q60654 280 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf139Q7TMV1 668 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf135Q9CWS1 417 aa23.52■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rap1gds1E9Q912 607 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q32P12 615 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Capn13Q3UW68 665 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Creb3l2Q8BH52 521 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp37Q8C0R0 979 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stard7Q8R1R3 373 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm5926E9PWJ8 236 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnk16G5E845 292 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aff1O88573 1216 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stmn4P63042 189 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map4k1P70218 827 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ItpkaQ8R071 459 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rassf3Q99P51 232 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf25Q9QZR0 456 aa23.51■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb6eI7HJI3 429 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CaluO35887 315 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NsfP46460 744 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zcwpw1Q6IR42 630 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Net1Q9Z206 595 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PatjQ63ZW7 1834 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mageb2A2AHM0 380 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Diaph2O70566 1098 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atf2P16951 487 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grm2Q14BI2 872 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cfap36Q8C6E0 343 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr3fQ921X6 316 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdk2Q9JK42 407 aa23.5■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mical3Q8CJ19 1993 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pde4aO89084 844 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pid1Q3UBG2 217 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q6DFW0 481 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zswim6Q80TB7 1207 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rhobtb2Q91V93 728 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SncbQ91ZZ3 133 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpatch1Q9DBM1 930 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm28360A0A087WR25 190 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm13084A2A8N0 494 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AunipE9Q6Z5 340 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cst8P32766 142 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igsf9Q05BQ1 1179 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf10Q3UIW5 804 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snf8Q9CZ28 258 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem174Q9DCX7 243 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbp7Q9EPC5 134 aa23.49■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup62clA2AG10 272 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrphP15331 475 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TxkP42682 527 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc117Q6PB51 277 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SnphQ80U23 495 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uroc1Q8VC12 676 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wrap53Q8VC51 532 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdha2Q91Y17 948 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hars2Q99KK9 505 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CtsfQ9R013 462 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf394Q9Z1D9 521 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PrkceP16054 737 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eno1P17182 434 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bmp2P21274 394 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Casp7P97864 303 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcf4Q60722 670 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dsg1aQ61495 1057 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppm1kQ8BXN7 372 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Proser2Q8C5R2 471 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rassf9Q8K342 435 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q9D2Q3 444 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mpp2Q9WV34 552 aa23.48■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prdm12A2AJ77 365 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ces1cP23953 554 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Siglec10Q80ZE3 688 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc50Q810U5 305 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp120Q8BZW4 436 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gbp7Q91Z40 638 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa23.47■■□□□ 1.35
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Skint3A7TZF0 458 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms