RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf354bQ9QXT9 601 aa12.61□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gadd45gQ9Z111 159 aa12.61□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mroh9G5E8L9 891 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hexim2Q3TVI4 313 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Llgl1Q80Y17 1036 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smc1bQ920F6 1248 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdzd4Q9QY39 772 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3127E9Q9P5 263 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3453K7N724 263 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3164L7N2B9 238 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3264L7N2C5 238 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtgisO35074 501 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tulp2P46686 562 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptgs2Q05769 604 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hace1Q3U0D9 909 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy2gQ6TL19 1100 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q91Z58 1206 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 TtpalQ9D3D0 343 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp358E9Q8M1 571 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casp14O89094 257 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 NeblQ0II04 452 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhl17Q6TDP3 640 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam205cQ80YD3 371 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ablim1Q8K4G5 861 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap57Q9D180 1249 aa12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Btnl4A2CG29 586 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm2030D3Z7C4 212 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3252E9PUT9 216 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3468E9QAJ8 216 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppm1jQ149T7 507 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smyd5Q3TYX3 416 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrch2Q3UMG5 773 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xkr4Q5GH67 647 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 MmeQ61391 750 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 FdxrQ61578 494 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa1841Q68FF0 718 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mms19Q9D071 1031 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Map7d2A2AG50 781 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 E030030I06RikJ3QML9 246 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh8P97291 799 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf113a2Q14B01 337 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 MlxipQ2VPU4 917 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nxf2Q4ZGD8 691 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc26a2Q62273 739 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q6PD19 689 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnma2Q8BHK0 365 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Haus1Q8BHX1 278 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmd5Q8BJY1 504 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam76aQ922G2 307 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt17Q9QWL7 433 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm4846B2RWH8 538 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 CcnoP0C242 352 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Podnl1Q6P3Y9 559 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spata20Q80YT5 790 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 VasnQ9CZT5 673 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 DcpsQ9DAR7 338 aa12.59□□□□□ -0.39
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcb5B5X0E4 1255 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3415J3QMS8 315 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acvr2bP27040 536 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grm2Q14BI2 872 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 GopcQ8BH60 463 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gprc5aQ8BHL4 356 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dusp19Q8K4T5 220 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plekhh3Q8VCE9 796 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 VillQ91YD6 859 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fuca2Q99KR8 461 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3404Q9D506 307 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atad5Q4QY64 1826 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rap1gapA2ALS5 663 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp266E9Q2S7 604 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trap1aP19473 224 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnl1P36916 607 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 NsfP46460 744 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf19aP50636 840 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sema4bQ62179 823 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wscd1Q80XH4 572 aa12.58□□□□□ -0.4
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uap1Q91YN5 522 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.6 ms