RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q8BGN9 141 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lamtor4Q8CF66 99 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Drap1Q9D6N5 205 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CenpkQ9ESN5 271 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tacc2Q9JJG0 1149 aa24.67■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl6a1O35257 230 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm5P49718 733 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mvb12bQ6KAU4 317 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 March6Q6ZQ89 909 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf579Q80VM4 562 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde5aQ8CG03 865 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uroc1Q8VC12 676 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc13a3Q91Y63 600 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem86aQ9D8N3 241 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl1Q9Z120 268 aa24.66■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm10801F7C7Q0 168 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr743L7N1Y2 311 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gdf6P43028 454 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnb1Q03717 857 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem109Q3UBX0 243 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UrgcpQ5NCI0 926 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znrf3Q5SSZ7 913 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dmc1Q61880 340 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap11aQ80Y19 987 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Them5Q9CQJ0 248 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc12Q9R022 198 aa24.65■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jbts17Q8CE72 3214 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4985A2ALC6 410 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyth3O08967 399 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syn1O88935 706 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PpardP35396 440 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SkiQ60698 725 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wscd1Q80XH4 572 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SowahaQ8BLS7 548 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naa30Q8CES0 364 aa24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Maml3D4QGC2 1135 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gp1bbP56400 206 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VegfaQ00731 214 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q6P2K3 674 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr412Q7TRW7 312 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hgh1Q8C3I8 393 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cst12Q9DAN8 128 aa24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdh23Q99PF4 3354 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap58B2RW38 873 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnt6P22727 364 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim43cP86449 446 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HyiQ8R1F5 277 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eps8l1Q8R5F8 716 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhb19Q91Y01 801 aa24.62■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Piezo2Q8CD54 2822 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcb2A3KGF7 1181 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam129cD3YZB0 591 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcp10bE9PYJ0 438 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcp10cE9Q046 482 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01878 344 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brcc3P46737 291 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mkl2P59759 1080 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ube2hP62257 183 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bmp1P98063 991 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Flt3Q00342 1000 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ephx1Q9D379 455 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Padi3Q9Z184 664 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arid2E9Q7E2 1828 aa24.61■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2b13A6H6J2 491 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxb8P09632 243 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc10a3P21129 473 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gadd45bP22339 160 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ca8P28651 291 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Shroom1Q5SX79 823 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arl5cQ6P068 179 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Thnsl1Q8BH55 747 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syn3Q8JZP2 579 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmx1Q8VBT0 278 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr345Q8VGK4 311 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpinb12Q9D7P9 423 aa24.6■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r19G5E8G4 854 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GlulP15105 373 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pax3P24610 479 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sdc2P43407 202 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf827Q505G8 1078 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SgczQ8BX51 311 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf2Q8C176 1104 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr24Q8CFJ9 790 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lgals2Q9CQW5 130 aa24.59■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DgkaO88673 730 aa24.58■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nek10Q3UGM2 1111 aa24.58■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CochQ62507 552 aa24.58■■□□□ 1.53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Casd1Q7TN73 797 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms