RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	UTR5	P32630	166 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TKL2	P33315	681 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CAB3	P36076	571 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MIC12	P38341	106 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CUE1	P38428	203 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ECM14	P38836	430 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YIL059C	P40520	121 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ECO1	P43605	281 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YJL028W	P47062	111 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MRH4	P53166	561 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YGL034C	P53186	121 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PGA2	P53903	129 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	EMI1	Q04406	187 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DCR2	Q05924	578 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YLR126C	Q12288	251 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TIM22	Q12328	207 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	COQ1	P18900	473 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	DRE2	P36152	348 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MRPL39	P36533	70 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MAL32	P38158	584 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TEM1	P38987	245 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MAL12	P53341	584 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPR063C	Q12160	140 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SEY1	Q99287	776 aa		0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YMR31	P19955	123 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RIB1	P38066	345 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ECM13	P38195	257 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RAD17	P48581	401 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YNL046W	P53956	172 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GOT1	Q03554	138 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YDR124W	Q04608	324 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SEI1	Q06058	285 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MRX4	Q12467	430 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	HIS3	P06633	220 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SNA3	P14359	133 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PPH21	P23594	369 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SFC1	P33303	322 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ERG28	P40030	148 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	COX15	P40086	486 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YER189W	P40104	122 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MDM34	P53083	459 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SLD7	Q08457	257 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PST1	Q12355	444 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	EMP46	Q12396	444 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.94	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SWI1	P09547	1314 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	ERD2	P18414	219 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	STE18	P18852	110 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	RNP1	P32385	249 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SSO1	P32867	290 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	SIP3	P38717	1229 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YNL194C	P40169	301 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	TRM9	P49957	279 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	MIC26	P50087	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CGR1	P53188	120 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	BNA7	Q04066	261 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	CDC123	Q05791	360 aa		0.93	□□□□□ -2.26
SPT21	YMR179W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms