RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	YDL009C	Q12210	107 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DRE2	YKR071C	TRM13	Q12383	476 aa		5.4	□□□□□ -1.54
DRE2	YKR071C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
DRE2	YKR071C	KIN28	P06242	306 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	IES6	P32617	166 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SLM1	P40485	686 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	MTL1	P53214	551 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YPR098C	Q06089	161 aa		5.39	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SEC66	P33754	206 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RRG9	P40156	214 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	FAR7	P43592	221 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	UFD1	P53044	361 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	VOA1	P53262	265 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	WSC2	P53832	503 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	OST6	Q03723	332 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YDR239C	Q03780	787 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	VIK1	Q12045	647 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	MSH5	Q12175	901 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YOR029W	Q12243	111 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		5.38	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	NAM2	P11325	894 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	UBC8	P28263	218 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	ACH1	P32316	526 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	GOS1	P38736	223 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	AGE2	P40529	298 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	HIS6	P40545	261 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YJL163C	P46996	555 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	TAX4	P47030	604 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YNR048W	P53740	393 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SAM50	P53969	484 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	FMP42	Q04991	504 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	AIM6	Q07716	390 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	FCY22	Q12119	530 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.37	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SIR2	P06700	562 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	PHO80	P20052	293 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SRL3	P36167	246 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YCR041W	P37265	110 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YPK3	P38070	525 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	PEX32	P38292	413 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	IPT1	P38954	527 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RMD6	P39975	231 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	AVT6	P40074	448 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	AIM20	P40451	204 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RET2	P43621	546 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SAY1	P53324	424 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	LOT6	Q07923	191 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	GSH2	Q08220	491 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YOR378W	Q08902	515 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	VCX1	Q99385	411 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	REC114	P32841	428 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YOX1	P34161	385 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	PRY2	P36110	329 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	FRM2	P37261	193 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	PSD1	P39006	500 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	PUG1	P40100	303 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YRB2	P40517	327 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	CIN2	P46670	268 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	GON7	P46984	123 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	COS10	P52924	374 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	SNZ1	Q03148	297 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	YDR248C	Q03786	193 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	CAC2	Q04199	468 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RFU1	Q08003	200 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.35	□□□□□ -1.55	not detected
DRE2	YKR071C	SAG1	P20840	650 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	TCA17	P32613	152 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	NPL6	P32832	435 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	MRPL6	P32904	214 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	RIB7	P33312	244 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	MTC2	P34246	357 aa		5.34	□□□□□ -1.55
DRE2	YKR071C	AAH1	P53909	347 aa		5.34	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.5 ms