RNA–Protein interactions for RNA: YKL038W

RGT1, Transcript of Glucose-responsive transcription factor, yeast

Gene RGT1, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGT1	YKL038W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MOT1	P32333	1867 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	GPI16	P38875	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YER158C	P40095	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ERG25	P53045	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YNL260C	P53846	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RSM10	Q03201	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DAL4	Q04895	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HEM25	Q07534	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	QCR2	P07257	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	POP5	P28005	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	COT1	P32798	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PAU24	P38155	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	LDB7	P38210	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	KEI1	Q06346	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	IRC10	Q08118	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ADK2	P26364	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DCG1	P32460	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YEF1	P32622	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	IRC22	P40006	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YIL067C	P40514	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TYW3	P53177	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RTT102	P53330	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SEI1	Q06058	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CUR1	Q06469	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MCH1	Q07376	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ERS1	P17261	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HOG1	P32485	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TIM23	P32897	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SLZ1	P40167	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SKP1	P52286	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	DAD3	P69850	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CDC14	Q00684	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YML096W	Q04489	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	OPI10	Q08202	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MYO1	P08964	1928 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HAP2	P06774	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MSN1	P22148	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ERG4	P25340	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	AVT7	P40501	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	BNS1	P50084	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	UBP8	P50102	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	IPK1	Q06667	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	GPM2	Q12008	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PST1	Q12355	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	LAS17	Q12446	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	EPT1	P22140	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	CNE1	P27825	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ERG3	P32353	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	MET30	P39014	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YAL037W	P39728	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ACA1	P39970	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YJL163C	P46996	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YNL034W	P53963	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	BSC6	Q08280	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TRS65	P32893	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	THI80	P35202	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YMC2	P38087	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	VID24	P38263	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SSN3	P39073	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SDP1	P40479	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	PAU15	P40585	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	POP1	P41812	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	NUP100	Q02629	959 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	TFS1	P14306	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	LSB5	P25369	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RGT1	YKL038W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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