RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	MET2	P08465	486 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	PET54	P10834	293 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MRPL3	P36516	390 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YGL082W	P53155	381 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MCT1	Q12283	360 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MGT1	P26188	188 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	TIP20	P33891	701 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	UPS2	P35200	230 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YKR041W	P36134	250 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MDM31	P38880	579 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MDV1	P47025	714 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	COS6	P53344	381 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	RFM1	Q12192	310 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	SFM1	Q12314	213 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	MRX4	Q12467	430 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	YDR416W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	GUF1	P46943	645 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SCS7	Q03529	384 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SRY1	P36007	326 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TOS8	P53147	276 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ATP23	P53722	227 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ARO80	Q04052	950 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	GMC1	Q04399	608 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SEI1	Q06058	285 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RDI1	Q12434	202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PCL9	Q12477	304 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CUP2	P15315	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	AEP1	P32493	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PET8	P38921	284 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YER076C	P40049	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	GAT1	P43574	510 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SUR7	P54003	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YET2	Q04210	160 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	LOA1	Q06508	300 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TFC7	Q12415	435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	AGA1	P32323	725 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YBR137W	P38276	179 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COS4	P43542	379 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COG5	P53951	403 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	INM2	Q05533	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	HEM4	P06174	275 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	DBF2	P22204	572 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MED8	P38304	223 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MTC6	P38849	526 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COX14	P39103	70 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	BDH1	P39714	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YIL029C	P40538	142 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YML018C	Q03730	393 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPN13	O13563	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YCR022C	P25620	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RCK1	P38622	512 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	OXA1	P39952	402 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	EAF6	P47128	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	SPG4	Q04438	115 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	ERV2	Q12284	196 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	GCN3	P14741	305 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MRP21	P38175	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	MOB2	P43563	287 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RCF2	P53721	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	GAS2	Q06135	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	COX5A	P00424	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	CDC43	P18898	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	THI80	P35202	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	YDR416W	BXI1	P48558	297 aa		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.7 ms