RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	GH1	P01241	217 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MAPK4	P31152	587 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	BPIFB4	P59827	614 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	KAZALD1	Q96I82	304 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	COPE	O14579	308 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LMNB2	Q03252	620 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SCARF1	Q14162	830 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CENPU	Q71F23	418 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SERPINI1	Q99574	410 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MTM1	Q13496	603 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ATG16L1	Q676U5	607 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MYCT1	Q8N699	235 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	STK33	Q9BYT3	514 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SENP1	Q9P0U3	644 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	C3	P01024	1663 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC9A1	P19634	815 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	HLF	Q16534	295 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LAD1	O00515	517 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PJA2	O43164	708 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGA8	P53708	1063 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ARPC4	P59998	168 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TFAP4	Q01664	338 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	MECOM	Q03112	1051 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SATL1	Q86VE3	508 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ACAP3	Q96P50	834 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DNM3	Q9UQ16	869 aa		12	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CLDN3	O15551	220 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	USP1	O94782	785 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	UCHL3	P15374	230 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CTSW	P56202	376 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PTEN	P60484	403 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	CAV1	Q03135	178 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PROM2	Q8N271	834 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	EME1	Q96AY2	570 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TBC1D12	O60347	775 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PDIA6	Q15084	440 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PDK3	Q15120	406 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SPIN3-231	ENST00000639895	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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