RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CAVIN2O95810 425 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ADH1AP07327 375 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC192P0DO97 292 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA4P13612 1032 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MLH1P40692 756 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GLUD2P49448 558 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PTENP60484 403 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL21Q9UKT6 434 aa26.58■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NEMFO60524 1076 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GLUD1P00367 558 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CFHP08603 1231 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52Z1P0C646 297 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1G1P47890 313 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SCNN1GP51170 649 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIN1Q05586 938 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CNNM3Q8NE01 707 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DYDC2Q96IM9 177 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CPB2Q96IY4 423 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALT6Q96L58 329 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR9Q96QG7 549 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK6Q96HP0 2047 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ASAP2O43150 1006 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31D3P0C874 917 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK4Q16566 473 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRA6Q6PI73 481 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX3O15119 743 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17AQ16552 155 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEDQ86YR6 584 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP11Q8WWU5 503 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 AXLP30530 894 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MBTD1Q05BQ5 628 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIA5Q14554 519 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 XKR9Q5GH70 373 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC7Q8WUI4 952 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC51Q96ER9 411 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TGM5O43548 720 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK3O94933 977 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 C1RP00736 705 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SRFP11831 508 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4A11Q02928 519 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.842e-8■■□□□ 14
CAPNS1-216ENST00000628306 NOTUMQ6P988 496 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MTRQ99707 1265 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ANHXE9PGG2 379 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ERLIN2O94905 339 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.845e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-216ENST00000628306 POU5F1BQ06416 359 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPSQ13938 189 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR65Q8IYL9 337 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 STAMQ92783 540 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CA14Q9ULX7 337 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALT5O43286 388 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL2P36404 184 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 TXLNAP40222 546 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR4Q13639 388 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CALCRLQ16602 461 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT10Q6P4F1 479 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ERMP1Q7Z2K6 904 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PALB2Q86YC2 1186 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR152Q8TDT2 470 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NXPE3Q969Y0 559 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D17Q9HA65 648 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FNIP2Q9P278 1114 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms