RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 IKBKBO14920 756 aa9.26□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 EFCAB14O75071 495 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP3O75969 853 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 RECQL4O94761 1208 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 AMHP03971 560 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 ADRB2P07550 413 aa9.26□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 GNA14O95837 355 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 EOMESO95936 686 aa9.25□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 HERVK_113Q902F9 699 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 SNX27Q96L92 541 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.25□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 RSAD1Q9HA92 442 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 RNF19AQ9NV58 838 aa9.25□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 LACTBL1A8MY62 500 aa9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 WNT7BP56706 349 aa9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 SPAG1Q07617 926 aa9.24□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.24□□□□□ -0.93
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