RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623185.3

LINC00963-216, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 786 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-216	ENST00000623185	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	GAD1	Q99259	594 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	APOL6	Q9BWW8	343 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	DERA	Q9Y315	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TTC3	P53804	2025 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	IKBKB	O14920	756 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	AKAP3	O75969	853 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TH	P07101	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CASP4	P49662	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	ZNF445	P59923	1031 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CLDN10	P78369	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	PSMD6	Q15008	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	ZBTB6	Q15916	424 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	USP37	Q86T82	979 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SNX27	Q96L92	541 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TLL1	O43897	1013 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CXCL8	P10145	99 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CYP3A5	P20815	502 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	MLH1	P40692	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	ZNF165	P49910	485 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LINC00963-216	ENST00000623185	PTGES	O14684	152 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	ALDH2	P05091	517 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	KRT13	P13646	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	AP3M2	P53677	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	GRIK3	Q13003	919 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	POMC	P01189	267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	SCNN1G	P51170	649 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	VAMP7	P51809	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	MYL5	Q02045	173 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	DSC1	Q08554	894 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	NAB2	Q15742	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	RAB30	Q15771	203 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LINC00963-216	ENST00000623185	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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