RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MYPNQ86TC9 1320 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CHKAP35790 457 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PDE6CP51160 858 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PTPRJQ12913 1337 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TLDC2A0PJX2 215 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 WDR64B1ANS9 1081 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RGS20O76081 388 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CFHP08603 1231 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KCNA3P22001 575 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 IVDP26440 423 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RMDN3Q96TC7 470 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 FSCN2O14926 492 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 JAK3P52333 1124 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TMC2Q8TDI7 906 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 NT5C1BQ96P26 610 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RASSF9O75901 435 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RARGP13631 454 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RWDD2BP57060 319 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCT6BQ92526 530 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SLCO2A1Q92959 643 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC38Q502W7 563 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 DOCK1Q14185 1865 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KRT17Q04695 432 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SNX1Q13596 522 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 IWS1Q96ST2 819 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.29□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CREB1P16220 341 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KCNA2P16389 499 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RRM1P23921 792 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KRT76Q01546 638 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MTMR2Q13614 643 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PLCB4Q15147 1175 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LPAR1Q92633 364 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 HVCN1Q96D96 273 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PWWP2AQ96N64 755 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PASKQ96RG2 1323 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ECEL1O95672 775 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 AGTP01019 485 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SFNP31947 248 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 GCNT1Q02742 428 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ADCY2Q08462 1091 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 DRP2Q13474 957 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LONRF1Q17RB8 773 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 ATG4CQ96DT6 458 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CABS1Q96KC9 395 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms