RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 TRANK1O15050 2925 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 HIDE1A8MVS5 230 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ERLIN2O94905 339 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 EYA4O95677 639 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CXCL14O95715 111 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GLP2RO95838 553 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PHKA2P46019 1235 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 RAB27AP51159 221 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SLC12A3P55017 1021 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 BCAR1P56945 870 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 NUCB2P80303 420 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 COASYQ13057 564 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CABP7Q86V35 215 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 VPS52Q8N1B4 723 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TCP11Q8WWU5 503 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 STAMQ92783 540 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CASP10Q92851 521 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM143Q96AN5 459 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CDK15Q96Q40 435 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PANK2Q9BZ23 570 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 RNF19AQ9NV58 838 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 USP20Q9Y2K6 914 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CITO14578 2027 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 NCOR1O75376 2440 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1B0GVL5 298 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CARNS1A5YM72 827 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 POM121CA8CG34 1229 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 FSCN2O14926 492 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GFRA3O60609 400 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CUTAO60888 179 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PFKFB1P16118 471 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 LIG1P18858 919 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CYP11B2P19099 503 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GLRA2P23416 452 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 NDUFA8P51970 172 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CAPSQ13938 189 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TFDP1Q14186 410 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 EMC2Q15006 297 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PDILTQ8N807 584 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 RNF149Q8NC42 400 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 RAD54LQ92698 747 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 EDAQ92838 391 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 SPATA32Q96LK8 384 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 FIZ1Q96SL8 496 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 APOL6Q9BWW8 343 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 NR2E1Q9Y466 385 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM221A6NGB7 291 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00963-215ENST00000622972 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms