RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF410Q86VK4 478 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM59Q8IWR1 403 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 UBXN4Q92575 508 aa23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 REV3LO60673 3130 aa23.39■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 ASAP2O43150 1006 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 STAG3L1P0CL83 205 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CTAGE9A4FU28 777 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 FGFR4P22455 802 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 RGS18Q9NS28 235 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CDC23Q9UJX2 597 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.38■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 PDXKO00764 312 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 MGEA5O60502 916 aa23.37■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 KCND2Q9NZV8 630 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.37■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 LINC01553A4QN01 128 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.36■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 SFR1Q86XK3 245 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.36■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35F6Q8N357 371 aa23.36■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 RNF149Q8NC42 400 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.35■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 LCA5LO95447 670 aa23.35■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 FIBCD1Q8N539 461 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 NEK11Q8NG66 645 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.35■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 RFXAPO00287 272 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 DGKIO75912 1065 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CASP5P51878 434 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 KCNMA1Q12791 1236 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 TFDP1Q14186 410 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CEP112Q8N8E3 955 aa23.34■■□□□ 1.33
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SGMS1-210ENST00000619438 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 CEP72Q9P209 647 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 EPHB6O15197 1021 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 KRT86O43790 486 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 ABL1P00519 1130 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 HOXD13P35453 343 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 NFIL3Q16649 462 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SPRED2Q7Z698 418 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SGMS1-210ENST00000619438 C9IYK1 514 aa23.32■■□□□ 1.32
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