RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 NXPE3Q969Y0 559 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 DRC1Q96MC2 740 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PNMA5Q96PV4 448 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KCNK12Q9HB15 430 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FNIP2Q9P278 1114 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIP11Q15643 1979 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 VWA8A3KMH1 1905 aa10.94□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FANCMQ8IYD8 2048 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PRR23AA6NEV1 266 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 HIP1RO75146 1068 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PAPLNO95428 1278 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 EFEMP2O95967 443 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PLA2G4BP0C869 781 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PLCG1P19174 1290 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NAMPTP43490 491 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PEX3P56589 373 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PTPAQ15257 358 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 MAPK6Q16659 721 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 AMHR2Q16671 573 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 USP41Q3LFD5 358 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FUT10Q6P4F1 479 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KCNK18Q7Z418 384 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 GPBP1Q86WP2 473 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 BSNDQ8WZ55 320 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ZFP42Q96MM3 310 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CLIC6Q96NY7 704 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 HES2Q9Y543 173 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 TCHHQ07283 1943 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF292O60281 2723 aa10.93□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CITO14578 2027 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SFI1A8K8P3 1242 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SPTLC2O15270 562 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM13AO94988 1023 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NPTXRO95502 500 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PRKCBP05771 671 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PKP1Q13835 747 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 MCM6Q14566 821 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SIX5Q8N196 739 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 EPSTI1Q96J88 318 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PANK2Q9BZ23 570 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 RNF39Q9H2S5 420 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 PIDD1Q9HB75 910 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CHST7Q9NS84 486 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 WNT16Q9UBV4 365 aa10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 CACNA1AO00555 2505 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 A0A1B0GUA9 196 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 N4BP3O15049 544 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 B4GALT5O43286 388 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC26A4O43511 780 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 TBCAO75347 108 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SRFP11831 508 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 STAT6P42226 847 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ME1P48163 572 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SMTNP53814 917 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 TUSC3Q13454 348 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC39A14Q15043 492 aa10.91□□□□□ -0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM187BQ17R55 369 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms