RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PRKCE	Q02156	737 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CARD9	Q9H257	536 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXD13	P35453	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RARA	P10276	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	YY1	P25490	414 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	GRM1	Q13255	1194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	QPCT	Q16769	361 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KRT76	Q01546	638 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	P3H1	Q32P28	736 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449		Q3C1V9	767 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	COG5	Q9UP83	839 aa		13.58	□□□□□ -0.23
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMA2	P25787	234 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EDIL3	O43854	480 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ARSE	P51690	589 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LENG9	Q96B70	501 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HSPA6	P17066	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	JAK3	P52333	1124 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RIT2	Q99578	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GLI3	P10071	1580 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DES	P17661	470 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	BPIFB4	P59827	614 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP11A	P98196	1134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CXCL9	Q07325	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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