RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616206.4

PDE4DIP-241, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-241ENST00000616206 SCLT1Q96NL6 688 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.34□□□□□ -1.07
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PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF208Q9H0X6 261 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 DNM3Q9UQ16 869 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4DIP-241ENST00000616206 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TGM5O43548 720 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PEX10O60683 326 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 KRT37O76014 449 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 ELNP15502 786 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MX1P20591 662 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 LTBRP36941 435 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ETV3P41162 512 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TDO2P48775 406 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 AK2P54819 239 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 HERVK_113P62684 666 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 GAS6Q14393 721 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 TEKT5Q96M29 485 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 SWAP70Q9UH65 585 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ARNTLO00327 626 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 OFD1O75665 1012 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 AKR1B1P15121 316 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 GABPAQ06546 454 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 C12orf60Q5U649 245 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 RNF38Q9H0F5 515 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CHST7Q9NS84 486 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 PRR13Q9NZ81 148 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 STAP2Q9UGK3 403 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.31□□□□□ -1.08
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PDE4DIP-241ENST00000616206 CCDC17Q96LX7 622 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4DIP-241ENST00000616206 GUCD1Q96NT3 240 aa8.31□□□□□ -1.08
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