RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL16	O15467	120 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	C8A	P07357	584 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ID4	P47928	161 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	COL4A2	P08572	1712 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	N4BP3	O15049	544 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCB	P05771	671 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MCM7	P33993	719 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	GPC5	P78333	572 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF13	Q92913	245 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TH	P07101	528 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SP9	P0CG40	484 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	LIG1	P18858	919 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXA9	P31269	272 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	STARD6	P59095	220 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ANAPC15	P60006	121 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEH	Q6S545	545 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	POLI	Q9UNA4	740 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CIT	O14578	2027 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338		I3L4J1	428 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	FGFR3	P22607	806 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1D2	P34982	312 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK6	Q16659	721 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ING5	Q8WYH8	240 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ACKR2	O00590	384 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	POU2F2	P09086	479 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP11B2	P19099	503 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	NAMPT	P43490	491 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCNKB	P51801	687 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB33A	Q14088	237 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ECM1	Q16610	540 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP120	Q8N960	986 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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