RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	FIZ1	Q96SL8	496 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PTPN18	Q99952	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	OGT	O15294	1046 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	VPS41	P49754	854 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PCYT2	Q99447	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ESYT3	A0FGR9	886 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ITGB3	P05106	788 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CLCN6	P51797	869 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	BPIFB4	P59827	614 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	AMHR2	Q16671	573 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	KAZN	Q674X7	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TADA3	O75528	432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	NPTXR	O95502	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	RARB	P10826	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SLC26A2	P50443	739 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	GUCY2D	Q02846	1103 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CST9	Q5W186	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	RAET1E	Q8TD07	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	GPC5	P78333	572 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	AKAP5	P24588	427 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CDH8	P55286	799 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CRHR2	Q13324	411 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	FGG	P02679	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	P4HA1	P13674	534 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ELN	P15502	786 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	CYP11B1	P15538	503 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	ASAP2	O43150	1006 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	FLT3LG	P49771	235 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	FCGRT	P55899	365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	SNX1	Q13596	522 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ILF3-222	ENST00000592763	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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