RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ODR4Q5SWX8 454 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 MYCT1Q8N699 235 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 CWH43Q9H720 699 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 CASP1P29466 404 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 DRP2Q13474 957 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 ALCAMQ13740 583 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC24A5Q71RS6 500 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 GPC3P51654 580 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 TMC7Q7Z402 723 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 SFR1Q86XK3 245 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 RGS18Q9NS28 235 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-214ENST00000592483 EVPLQ92817 2033 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MGEA5O60502 916 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PHKA2P46019 1235 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NPTX2P47972 431 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PEX3P56589 373 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT17Q04695 432 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPSQ13938 189 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM2Q99965 735 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MYH11P35749 1972 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 DENND3A2RUS2 1198 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 C9IYK1 514 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 VTNP04004 478 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 EFNA5P52803 228 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NCKAP1LP55160 1127 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 17.3
CAPNS1-214ENST00000592483 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 DEPTORQ8TB45 409 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 BSNDQ8WZ55 320 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 HVCN1Q96D96 273 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFHX4Q86UP3 3567 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRIQ4A6NIV6 560 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC169A6NNP5 214 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SFI1A8K8P3 1242 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR32O75388 356 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 EOMESO95936 686 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 WEE2P0C1S8 567 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PPM1AP35813 382 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R2P41236 205 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF149Q8NC42 400 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP4Q96MN2 994 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 R4GN57 208 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SPTBN2O15020 2390 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE4BO95155 1302 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF20AO95235 890 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PTENP60484 403 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 TDGQ13569 410 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP7Q8WX94 980 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 RUBCNQ92622 972 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SCLT1Q96NL6 688 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 FIZ1Q96SL8 496 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 HINFPQ9BQA5 517 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAMTS10Q9H324 1103 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM134Q9H6X4 195 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL21Q9UKT6 434 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 K7ENM7 598 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS6KA5O75582 802 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 FGFR1P11362 822 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM189BP81408 668 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.84■■□□□ 1.73
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