RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 KCNK12Q9HB15 430 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 GDAQ9Y2T3 454 aa20.11■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 ZMYND10O75800 440 aa20.1■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.1■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 MCTP1Q6DN14 999 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 CEP57Q86XR8 500 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.08■□□□□ 0.81
CTIF-206ENST00000588345 CEP120Q8N960 986 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 UROC1Q96N76 676 aa20.08■□□□□ 0.81
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CTIF-206ENST00000588345 PROZP22891 400 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 CLCN5P51795 746 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 UPP1Q16831 310 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 PNMA5Q96PV4 448 aa20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.07■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 CITO14578 2027 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 B3GAT3O94766 335 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 HOXA9P31269 272 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 MTRRQ9UBK8 725 aa20.06■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.06■□□□□ 0.8
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CTIF-206ENST00000588345 MCF2P10911 925 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 LAMP2P13473 410 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 NPR3P17342 541 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 RAB33AQ14088 237 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 LIN9Q5TKA1 542 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.05■□□□□ 0.8
CTIF-206ENST00000588345 SNX27Q96L92 541 aa20.05■□□□□ 0.8
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