RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586541.5

PRKAR1A-212, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PRKAR1A, Length 570 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-212ENST00000586541 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 DRC7Q8IY82 874 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PTPRN2Q92932 1015 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 WNK4Q96J92 1243 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYH1P12882 1939 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 BECN2A8MW95 431 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 KIF28PB7ZC32 967 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF213O14771 459 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLD2O14939 933 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NEMFO60524 1076 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MSCO60682 206 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDE8BO95263 885 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 EFEMP2O95967 443 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC5A1P13866 664 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PDE6AP16499 860 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CAPN2P17655 700 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 TRDNQ13061 729 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 DLGAP5Q15398 846 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NR0B2Q15466 257 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADALQ6DHV7 355 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MOB2Q70IA6 237 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NBPF11Q86T75 865 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYLIPQ8WY64 445 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 DPF3Q92784 378 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MXD3Q9BW11 206 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CDH23Q9H251 3354 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 GPR27Q9NS67 375 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYH8P13535 1937 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 A0A1W2PQC6 194 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 SPTLC2O15270 562 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MYO1BO43795 1136 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 NPHS1O60500 1241 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 RAC2P15153 192 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PHKA1P46020 1223 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 GALK1P51570 392 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 LRMPQ12912 555 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CFAP100Q494V2 611 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 FYB2Q5VWT5 728 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ANO1Q5XXA6 986 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 APOA5Q6Q788 366 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CBLL1Q75N03 491 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 MICU3Q86XE3 530 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 Q8N3U1 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 LPIN2Q92539 896 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ASIC4Q96FT7 647 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 PTPN18Q99952 460 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ALG1Q9BT22 464 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 GULP1Q9UBP9 304 aa6.28□□□□□ -1.4
PRKAR1A-212ENST00000586541 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms