RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EDNRBP24530 442 aa17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DR1Q01658 176 aa17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTMR3Q13615 1198 aa17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.7■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa17.7■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DEPTORQ8TB45 409 aa17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.7■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM134Q9H6X4 195 aa17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BTBD7Q9P203 1132 aa17.7■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 K7ERI5 159 aa17.69■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHRNA3P32297 505 aa17.69■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERP44Q9BS26 406 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HAPLN2Q9GZV7 340 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCYOX1Q9UHG3 505 aa17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-DRAP01903 254 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNNI1P19237 187 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BPIFB4P59827 614 aa17.68■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMC3Q7Z5M5 1100 aa17.68■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRELID2Q8N945 189 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELMO3Q96BJ8 720 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DPH5Q9H2P9 285 aa17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NRBP2Q9NSY0 501 aa17.68■□□□□ 0.42
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0B4J269 797 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOWAHBA6NEL2 793 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VNN1O95497 513 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYBL1P10243 752 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TGFB3P10600 412 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PYGMP11217 842 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COPB2P35606 906 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCTD16Q68DU8 428 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH2D3CQ8N5H7 860 aa17.67■□□□□ 0.42
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