RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	NECAB1	Q8N987	351 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	JMY	Q8N9B5	988 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGB	Q92521	554 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LPIN2	Q92539	896 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	WASF1	Q92558	559 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRN2	Q92932	1015 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PAPPA	Q13219	1627 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT7	O00154	380 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CPLX1	O14810	134 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	WNT9A	O14904	365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MUSK	O15146	869 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PDPK1	O15530	556 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF623	O75123	536 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	C6	P13671	934 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC5A1	P13866	664 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CPA1	P15085	419 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GDF5	P43026	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RCAN1	P53805	252 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TPM4	P67936	248 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RASGRF1	Q13972	1273 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR19	Q15760	415 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	BICD2	Q8TD16	824 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LMF1	Q96S06	567 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC6	Q99741	560 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN18	Q99952	460 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT23	Q9C075	422 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF609	O15014	1411 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LRP6	O75581	1613 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RTL9	Q8NET4	1388 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY3	O60266	1144 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LARGE1	O95461	756 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	YEATS4	O95619	227 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY5	O95622	1261 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FSHB	P01225	129 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FGA	P02671	866 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBB4A	P04350	444 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	POLD1	P28340	1107 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GJA4	P35212	333 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LIFR	P42702	1097 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	REST	Q13127	1097 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM29	Q14134	588 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	MTERF2	Q49AM1	385 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC24	Q50LG9	513 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	FIGN	Q5HY92	759 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAL	Q6DHV7	355 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATC1	Q76KD6	591 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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