RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP38Q8NB14 1042 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 LMO3Q8TAP4 145 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAGE1Q8TC20 777 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM212AQ96EL1 285 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACAP3Q96P50 834 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.33■■□□□ 1.65
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRJQ12913 1337 aa25.33■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.33■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL18RAPO95256 599 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL6A1P12109 1028 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACTN1P12814 892 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 APBA1Q02410 837 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR49Q8IV35 697 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHST12Q9NRB3 414 aa25.32■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 GHRP10912 638 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 AP3M2P53677 418 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBED6P86452 979 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 LPIN1Q14693 890 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZACNQ401N2 412 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBXN11Q5T124 520 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PANX2Q96RD6 677 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIX2Q9NPC8 291 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP72Q9P209 647 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PADI3Q9ULW8 664 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 GANQ9H2C0 597 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASB7Q9H672 318 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.31■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 UCHL3P15374 230 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMX1Q9H3N1 280 aa25.3■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD52P31358 61 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAK2Q13177 524 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 BFSP2Q13515 415 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM84AQ96KN4 292 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 DNAJC7Q99615 494 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB20Q9NX57 234 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SNTG2Q9NY99 539 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 HES2Q9Y543 173 aa25.29■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 LACTBL1A8MY62 500 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRN2O75325 713 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCZ1BP86790 482 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAP1Q92560 729 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEMA4DQ92854 862 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOX2Q96NM4 488 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANK1P16157 1881 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SELPP16109 830 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD302Q8IX05 232 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.28■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 SKILP12757 684 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAPN2P17655 700 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 BIRC3Q13489 604 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 MBTPS1Q14703 1052 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.27■■□□□ 1.64
RARA-AS1-201ENST00000581080 PITPNM1O00562 1244 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa25.26■■□□□ 1.63
RARA-AS1-201ENST00000581080 RRAGAQ7L523 313 aa25.26■■□□□ 1.63
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