RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TEKT4Q8WW24 435 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 VOPP1Q96AW1 172 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 FAM89AQ96GI7 184 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM169Q96HH4 297 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 EPSTI1Q96J88 318 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf74Q96LT6 269 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CRBNQ96SW2 442 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SH3GL3Q99963 347 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CAPS2Q9BXY5 557 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DLL4Q9NR61 685 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SMYD2Q9NRG4 433 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SNTG2Q9NY99 539 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 AIPL1Q9NZN9 384 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 ZIM2Q9NZV7 527 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SIRPGQ9P1W8 387 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PPT2Q9UMR5 302 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 EMC9Q9Y3B6 208 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRM-204ENST00000577468 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 FAM221BA6H8Z2 402 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TSPY2A6NKD2 308 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KDM1AO60341 852 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RAD17O75943 681 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KCNH1O95259 989 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 STAMBPO95630 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A1P02730 911 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ADH4P08319 380 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TSPY3P0CV98 308 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TSPY8P0CW00 308 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMOD1P28289 359 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CSF2RBP32927 897 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CA8P35219 290 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KRT20P35900 424 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RAB27AP51159 221 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PDE6CP51160 858 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RENBPP51606 427 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RCAN1P53805 252 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CTAG1AP78358 180 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMF1P82094 1093 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 DGCR2P98153 550 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TSPY1Q01534 308 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PAK2Q13177 524 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PRKG2Q13237 762 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 GRM1Q13255 1194 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MLC1Q15049 377 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TKFCQ3LXA3 575 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 BTNL9Q6UXG8 535 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM110Q86TL2 294 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 DGKHQ86XP1 1220 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MSANTD4Q8NCY6 345 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC45Q96CN5 670 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 VCX3BQ9H321 246 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 KANSL2Q9H9L4 492 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 RASSF1Q9NS23 344 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 WASF3Q9UPY6 502 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms