RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574085.5

TRPV1-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, human

TSL 2

Gene TRPV1, Length 2,644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SPOP	O43791	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	KCNA3	P22001	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ITGA8	P53708	1063 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	LMNB2	Q03252	620 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SNF8	Q96H20	258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TCEA3	O75764	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SKI	P12755	728 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ITIH2	P19823	946 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	GPC5	P78333	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	RCN1	Q15293	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MAGEB2	O15479	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CLDN3	O15551	220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CREB3	O43889	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ASMTL	O95671	621 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	GSTA2	P09210	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	PTPN4	P29074	926 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	KIF22	Q14807	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CD101	Q93033	1021 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	LRRC19	Q9H756	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ECE2	O60344	883 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	VPS41	P49754	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CDR2	Q01850	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MIPEP	Q99797	713 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TOM1	O60784	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	KRT36	O76013	467 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	RXRB	P28702	533 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	TLE6	Q9H808	572 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ATF2	P15336	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	ZNF24	P17028	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SERPINB4	P48594	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MYL7	Q01449	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	MPP3	Q13368	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPV1-208	ENST00000574085	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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