RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479		H0YCG3	227 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TOM1L1	O75674	476 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	KIF4A	O95239	1232 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MYB	P10242	640 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SYT1	P21579	422 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	GRIN1	Q05586	938 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PDXDC1	Q6P996	788 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	UROC1	Q96N76	676 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.3	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM221	A6NGB7	291 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R296	226 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CLDN3	O15551	220 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TGM5	O43548	720 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	B3GAT3	O94766	335 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	BRD1	O95696	1058 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PROZ	P22891	400 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	DDIT3	P35638	169 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CLCNKB	P51801	687 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MCM6	Q14566	821 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	UPP1	Q16831	310 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	LILRA6	Q6PI73	481 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP120	Q8N960	986 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	RAD54L	Q92698	747 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM122A	Q96E09	287 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PIDD1	Q9HB75	910 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		10.29	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	C5orf42	Q9H799	3197 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ABLIM1	O14639	778 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAK2	O60296	914 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	RFPL2	O75678	378 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM13A	O94988	1023 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNE1	P15382	129 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PLCG1	P19174	1290 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SCP2	P22307	547 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	REST	Q13127	1097 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPA	Q15257	358 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD5	Q16401	504 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SPECC1	Q5M775	1068 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.28	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms