RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557519.1

RPS29-208, Transcript of ribosomal protein S29, human

TSL 3

Gene RPS29, Length 333 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS29-208	ENST00000557519	POSTN	Q15063	836 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	FUT10	Q6P4F1	479 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CD302	Q8IX05	232 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ACCS	Q96QU6	501 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PER2	O15055	1255 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	OGT	O15294	1046 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GCNT3	O95395	438 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	C1R	P00736	705 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	EDN1	P05305	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ITIH3	Q06033	890 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SFR1	Q86XK3	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	DHX58	Q96C10	678 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SNX27	Q96L92	541 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PANK2	Q9BZ23	570 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PANK4	Q9NVE7	773 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	USP25	Q9UHP3	1055 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MYMK	A6NI61	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	C2CD2L	O14523	706 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PTGES	O14684	152 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MBTPS2	O43462	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TBX10	O75333	385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	KCNE1	P15382	129 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PAX3	P23760	479 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ASIC1	P78348	528 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	DSG1	Q02413	1049 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CLUL1	Q15846	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	RESP18	Q5W5W9	173 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	FNIP2	Q9P278	1114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	REV3L	O60673	3130 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	LINC01565	O15544	149 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	B3GAT3	O94766	335 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	KIF4A	O95239	1232 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	GLUD1	P00367	558 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	MYL1	P05976	194 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	CYP3A5	P20815	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RPS29-208	ENST00000557519	LTBR	P36941	435 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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