RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553846.1

PRKCH-208, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-208	ENST00000553846	GNA11	P29992	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	AXL	P30530	894 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	NRL	P54845	237 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PSMC5	P62195	406 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RAB33A	Q14088	237 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ING5	Q8WYH8	240 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	B4GALT5	O43286	388 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	XYLB	O75191	536 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	AKAP5	P24588	427 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	HOXC13	P31276	330 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RFC5	P40937	340 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CCR3	P51677	355 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	EMC2	Q15006	297 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PSMD5	Q16401	504 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RTL10	Q7L3V2	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC37A4	O43826	429 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MOSPD3	O75425	235 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RHO	P08100	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FGFR3	P22607	806 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	HOXA6	P31267	233 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CCR2	P41597	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FNTB	P49356	437 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PTGDR	Q13258	359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	TUSC3	Q13454	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CAPS	Q13938	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	RAB23	Q9ULC3	237 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846		A0A1B0GUA9	196 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MAN2B1	O00754	1011 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ZBTB39	O15060	712 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ASAP2	O43150	1006 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	NR1I2	O75469	434 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	MICAL2	O94851	1124 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ERLIN2	O94905	339 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	CNR2	P34972	360 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	GRM2	Q14416	872 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	ACAP1	Q15027	740 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	VIT	Q6UXI7	678 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCH-208	ENST00000553846	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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