RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 RARRES1P49788 294 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 CREMQ03060 361 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 TUSC3Q13454 348 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.456e-13■□□□□ 9.5
CS-227ENST00000551441 NOSTRINQ8IVI9 506 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 SHDQ96IW2 340 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 BCO2Q9BYV7 579 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 POLD4Q9HCU8 107 aa17.84■□□□□ 0.45
CS-227ENST00000551441 NCDNQ9UBB6 729 aa17.84■□□□□ 0.45
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CS-227ENST00000551441 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PIK3R5Q8WYR1 880 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 MCRS1Q96EZ8 462 aa17.83■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.83■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 ANKEF1Q9NU02 776 aa17.83■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 GDAQ9Y2T3 454 aa17.83■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 I3L4J1 428 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 RECQL4O94761 1208 aa17.82■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 MTSS1LQ765P7 747 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 DLL3Q9NYJ7 618 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 XYLBO75191 536 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CTDNEP1O95476 244 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 C1RP00736 705 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 THP07101 528 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 XBP1P17861 261 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 KRT2P35908 639 aa17.81■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 BSNDQ8WZ55 320 aa17.81■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.81■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 KRT37O76014 449 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CDKL5O76039 1030 aa17.8■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 ATP2B1P20020 1258 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PRKCQQ04759 706 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 NAB2Q15742 525 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 SLC5A9Q2M3M2 681 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ATRIPQ8WXE1 791 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 NFKBIZQ9BYH8 718 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 HEBP1Q9NRV9 189 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PRKCBP05771 671 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CEBPBP17676 345 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TKTP29401 623 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 BRCC3P46736 316 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 LPAL2Q16609 132 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TANGO2Q6ICL3 276 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 NECAB1Q8N987 351 aa17.79■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 FZD8Q9H461 694 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 STK36Q9NRP7 1315 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 N4BP3O15049 544 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 MED24O75448 989 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 FDPSP14324 419 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 CLCNKBP51801 687 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ARPP19P56211 112 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 RAB33AQ14088 237 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 GRM2Q14416 872 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 USP18Q9UMW8 372 aa17.78■□□□□ 0.44
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