RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NOX5Q96PH1 765 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RNF19AQ9NV58 838 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MYO6Q9UM54 1294 aa9.09□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 A6NJR5 290 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TRPA1O75762 1119 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PIGRP01833 764 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KRT19P08727 400 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CCDC172P0C7W6 258 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PRKCIP41743 596 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PRKCZQ05513 592 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TRIM32Q13049 653 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZACNQ401N2 412 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TRIM58Q8NG06 486 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HELQQ8TDG4 1101 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 KAT2BQ92831 832 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ERO1AQ96HE7 468 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 OSMRQ99650 979 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FZD8Q9H461 694 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDC23Q9UJX2 597 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PPME1Q9Y570 386 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GPR25O00155 361 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 OGTO15294 1046 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ASAP2O43150 1006 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PALMO75781 387 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HOXC6P09630 235 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GPC3P51654 580 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HTRA3P83110 453 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NAB2Q15742 525 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZNF394Q53GI3 561 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SOCS4Q8WXH5 440 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 WDR81Q562E7 1941 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MYADML2A6NDP7 307 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TREHO43280 583 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 H2AFZP0C0S5 128 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CYP2C9P11712 490 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ELNP15502 786 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CD58P19256 250 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 GALCP54803 685 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FCGRTP55899 365 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CAP1Q01518 475 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NCOA4Q13772 614 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MFSD10Q14728 455 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 H2AFVQ71UI9 128 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CAGE1Q8TC20 777 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TRIB2Q92519 343 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 CDT1Q9H211 546 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 EVPLQ92817 2033 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZEB2O60315 1214 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 VNN1O95497 513 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MMEP08473 750 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TM4SF4P48230 202 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MCL1Q07820 350 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HIC1Q14526 733 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 C2CD6Q53TS8 623 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TMEM270Q6UE05 265 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 USP6NLQ92738 828 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 AGPAT1Q99943 283 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 HINFPQ9BQA5 517 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-215ENST00000549143 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms