RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 PDXKO00764 312 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 LRRN2O75325 713 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ITGB1P05556 798 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 CYP24A1Q07973 514 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 DSC1Q08554 894 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ZNF516Q92618 1163 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SLC9A7Q96T83 725 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 RSAD1Q9HA92 442 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MARCH5Q9NX47 278 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 LINC01553A4QN01 128 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 CLDN3O15551 220 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 EXTL3O43909 919 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 EFEMP2O95967 443 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 POMCP01189 267 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 AMHP03971 560 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TRIM49P0CI25 452 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TRIM49CP0CI26 452 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ACTN1P12814 892 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ITGA4P13612 1032 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 NR2F2P24468 414 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SLC11A1P49279 550 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 RAB27AP51159 221 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PAK1Q13153 545 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 IQCB1Q15051 598 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ZBTB6Q15916 424 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 STX1AQ16623 288 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 JADE1Q6IE81 842 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 GPD1LQ8N335 351 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 LRCH3Q96II8 777 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TMEM206Q9H813 350 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PARP2Q9UGN5 583 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SIX4Q9UIU6 781 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MYH10P35580 1976 aa9.04□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 VNN1O95497 513 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 EOMESO95936 686 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 CA3P07451 260 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 CLTAP09496 248 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 KCNE1P15382 129 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SCP2P22307 547 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 KCNJ6P48051 423 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TAP1Q03518 808 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PPP3CAQ08209 521 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PSMD6Q15008 389 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 AOPEPQ8N6M6 819 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 MLKLQ8NB16 471 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 RDH13Q8NBN7 331 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 NOTCH4Q99466 2003 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-206ENST00000546930 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-206ENST00000546930 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-206ENST00000546930 PSMA7O14818 248 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-206ENST00000546930 SPTLC1O15269 473 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-206ENST00000546930 AP5Z1O43299 807 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-206ENST00000546930 EFCAB14O75071 495 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms