RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 STAT5BP51692 787 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 VAMP7P51809 220 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 JAM2P57087 298 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MYL7Q01449 175 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KIF5AQ12840 1032 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RDH13Q8NBN7 331 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 KCNN1Q92952 543 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PORCNQ9H237 461 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 L1RE1Q9UN81 338 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TFR2Q9UP52 801 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PLXNB2O15031 1838 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RCCD1A6NED2 376 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 P4HA2O15460 535 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 LGR5O75473 907 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CNGA1P29973 690 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ARL2P36404 184 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MAGEA1P43355 309 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NAMPTP43490 491 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ARID5AQ03989 594 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NAA25Q14CX7 972 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SNCBQ16143 134 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 DBN1Q16643 649 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 IQCEQ6IPM2 695 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SPDL1Q96EA4 605 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FAM167AQ96KS9 214 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GPR20Q99678 358 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 AZI2Q9H6S1 392 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RRAGCQ9HB90 399 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PPME1Q9Y570 386 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 EMSYQ7Z589 1322 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 C2orf72A6NCS6 295 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PMM2O15305 246 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PJA2O43164 708 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC34A2O95436 690 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ADRB2P07550 413 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GARTP22102 1010 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 RFX1P22670 979 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 GLRA2P23416 452 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ANXA13P27216 316 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PRKCIP41743 596 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 STAT1P42224 750 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CDR1P51861 262 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 DLG4P78352 724 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 PPP3CAQ08209 521 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CETN1Q12798 172 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 TTLL4Q14679 1199 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SLC18A3Q16572 532 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 SPRYD7Q5W111 196 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-204ENST00000546621 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms