RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007	SPEF2	Q9C093	1822 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.41	□□□□□ -1.86
MRPL48-208	ENST00000537007		H0Y8X5	98 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	KLF4	O43474	513 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	B4GALT4	O60513	344 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MSC	O60682	206 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IGF2R	P11717	2491 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ITGA4	P13612	1032 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GART	P22102	1010 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	HSD3B2	P26439	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ETFB	P38117	255 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TAP1	Q03518	808 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TCEAL1	Q15170	157 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SPATA18	Q8TC71	538 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RHOV	Q96L33	236 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TBX21	Q9UL17	535 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	XDH	P47989	1333 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MED23	Q9ULK4	1368 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007		F6X3S4	739 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CXCL11	O14625	94 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NPHS1	O60500	1241 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FGB	P02675	491 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MYL6B	P14649	208 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SEPHS1	P49903	392 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ITGA1	P56199	1179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	RAB33A	Q14088	237 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CLUL1	Q15846	466 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NLRP10	Q86W26	655 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM199	Q8N511	208 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TRPV1	Q8NER1	839 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007		Q8TCH9	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	NKD1	Q969G9	470 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	VOPP1	Q96AW1	172 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	APBA2	Q99767	749 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	COA1	Q9GZY4	146 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IL23A	Q9NPF7	189 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SI	P14410	1827 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	UTY	O14607	1347 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	TNKS	O95271	1327 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PTPRS	Q13332	1948 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	STXBP3	O00186	592 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MRPL48-208	ENST00000537007	ENPP3	O14638	875 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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