RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SPEG	Q15772	3267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	IGF2R	P11717	2491 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NCAM2	O15394	837 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ERLIN2	O94905	339 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RHO	P08100	348 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	POU2F2	P09086	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNB1	P11230	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	AXL	P30530	894 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCR2	P41597	374 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GRIK3	Q13003	919 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CAPS	Q13938	189 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WWV3	80 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1B0GUA9	196 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		K7ESF4	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ASAP2	O43150	1006 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	LRP3	O75074	770 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	XYLB	O75191	536 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RFC5	P40937	340 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SHC2	P98077	582 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CREM	Q03060	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC6	Q16204	474 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZUG5	572 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	HAS1	Q92839	578 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	BRF1	Q92994	677 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	COL4A2	P08572	1712 aa		13.5	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NID2	Q14112	1375 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MOSPD3	O75425	235 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	FGFR3	P22607	806 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GLRA2	P23416	452 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ARL2	P36404	184 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NRL	P54845	237 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	NLRP5	P59047	1200 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TUSC3	Q13454	348 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf19	Q8IY42	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	FAM3C	Q92520	227 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	LXN	Q9BS40	222 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MTRR	Q9UBK8	725 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		I3L4J1	428 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ARNTL	O00327	626 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	C1QTNF9	P0C862	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	IFNAR1	P17181	557 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	VIPR2	P41587	438 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CXCL12	P48061	93 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	INF2	Q27J81	1249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZS52	159 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MTR	Q99707	1265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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