RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 ABHD8Q96I13 439 aa28.7■■■□□ 2.19
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF39Q9H2S5 420 aa28.7■■■□□ 2.19
NDUFS3-211ENST00000533507 KLK14Q9P0G3 267 aa28.7■■■□□ 2.19
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 RECQL4O94761 1208 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 IL18RAPO95256 599 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 MYL7Q01449 175 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 VSTM4Q8IW00 320 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 HACE1Q8IYU2 909 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CGRRF1Q99675 332 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.7■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ITGA4P13612 1032 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 KLK7P49862 253 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 MXI1P50539 228 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CETN1Q12798 172 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 BIRC3Q13489 604 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 DSC3Q14574 896 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 FTHL17Q9BXU8 183 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.69■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SCN5AQ14524 2016 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TIMP1P01033 207 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CDC25BP30305 580 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 LPPQ93052 612 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 RNF19AQ9NV58 838 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PTPRJQ12913 1337 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CLSTN1O94985 981 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 KRT39Q6A163 491 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 GBP6Q6ZN66 633 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF516Q92618 1163 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PHACTR2O75167 634 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM191BP0C7N4 346 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB27AP51159 221 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 JADE1Q6IE81 842 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SV2AQ7L0J3 742 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR49Q8IV35 697 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ASB7Q9H672 318 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 RGS18Q9NS28 235 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 GCNT4Q9P109 453 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A0U1RQF3 1178 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TTC26A0AVF1 554 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ITGB8P26012 769 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 GTF2H1P32780 548 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ENPEPQ07075 957 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 APBB2Q92870 758 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF12Q96FN5 646 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.183e-6■■■■■ 84.1
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CITO14578 2027 aa28.66■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 A0A1W2PQC6 194 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 KIAA0355O15063 1070 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 NFICP08651 508 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SKIP12755 728 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNMA1Q12791 1236 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 GLRA4Q5JXX5 417 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CPLX3Q8WVH0 158 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SNX27Q96L92 541 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TNNC2P02585 160 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC9A1P19634 815 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PBX1P40424 430 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CLDN10P78369 228 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC24A5Q71RS6 500 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CD302Q8IX05 232 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.65■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PTMAP06454 111 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM132DQ14C87 1099 aa28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TET1Q8NFU7 2136 aa28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 PGBD4Q96DM1 585 aa28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.64■■■□□ 2.18
NDUFS3-211ENST00000533507 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa28.63■■■□□ 2.17
NDUFS3-211ENST00000533507 CXCL10P02778 98 aa28.63■■■□□ 2.17
NDUFS3-211ENST00000533507 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
NDUFS3-211ENST00000533507 CSF2RAP15509 400 aa28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms