RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 IGBP1P78318 339 aa21.75■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 EP400NLQ6ZTU2 488 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.75■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 CCDC114Q96M63 670 aa21.75■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 TSKSQ9UJT2 592 aa21.75■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 TRIM49CP0CI26 452 aa21.74■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.74■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 SAAL1Q96ER3 474 aa21.73■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.73■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.72■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 CENPHQ9H3R5 247 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.72■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 E7EVH7 732 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 CA12O43570 354 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 BUB1O43683 1085 aa21.71■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.71■■□□□ 1.07
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TSTA3-214ENST00000531473 PPTC7Q8NI37 304 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 SLC9A1P19634 815 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 CNGA1P29973 690 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 CLCN3P51790 818 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-214ENST00000531473 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.71■■□□□ 1.07
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