RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CGRRF1Q99675 332 aa9.22□□□□□ -0.93
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNX27Q96L92 541 aa9.2□□□□□ -0.94
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.2□□□□□ -0.94
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.2□□□□□ -0.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.943e-9■■□□□ 11.5
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.19□□□□□ -0.94
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